1、  热熔融加工性能，全氟磺酸树脂通常都是在加热到熔融状态后进行挤塑成膜的，成单膜后还需加热到软化状态进行复合和增强，所以作为全氟磺酸离子膜主要基体材料的全氟磺酸树脂必须具有能熔融加工的性能，SO3H和SO3Na形态的全氟磺酸树脂不能适应熔融加工的要求，只有带有末端基团为SO3F的全氟磺酸树脂适合熔融加工，SO3F基团本身不具有离子交换功能，它很容易通过与氢氧化钠水溶液反应转变成SO3Na基团。

2、  热稳定性，全氟磺酸树脂具有良好的热稳定性，它可以在200度左右的温度下长期保持稳定。起始分解温度是指材料在受热状态下随着温度上升其质量开始发生变化的温度。一般取样品质量减少达到1%时的温度作为它的起始温度。全氟磺酸树脂起始温度在310度以上。

3、  后处理，对溶液聚合所得共聚物可采用降低温度加入水等其他溶剂的办法降低其在介质中的溶解度，使之完全析出。由于在聚合过程中会产生一些热不稳定的羧酸或酰氟型端基，同时也还会由于聚合过程中不可避免地发生一些链转移作用而使少量的低聚物存在，因而与溶剂分离之后的聚合物不宜直接进行干燥、造粒和加工，必须进行必要的端基稳定化处理，以得到高质量的聚合物。