Nafion催化脂肪醇的醚化，低温对伯醇、仲醇的气相醚化有利，100°C的转化率达100%，较高温度下只有烯烃生成，叔丁醇即使在低温也只生成2-甲基丙烯。液相中，二醇生成环醚，如将1,4-二醇或1,5-二醇在135°C下用nafion树脂催化脱水，可顺利得到环醚。此反应无需溶剂，产率在86%以上，其中1,4-丁二醇生成90%以上的四氢呋喃，欲得较大环醚，产率也就下降，如1,7-庚二醇合成八元环醚产率仅为50%。Olah等报道了nafion可有效催化醇的双分子醚化，生成的水可用甲苯共沸除去。如145°C下，二正己基醚产率可达97%，二正癸基醚可达95%，而二级醇双分子醚化产率则较低。

Nafion还能有效催化乙二醇的聚合，生成聚乙二醇，只需加热乙二醇至140度以上，并及时除水，而amberlyst树脂则受温度的限制而不能奏效。为探求醇脱水成醚的机理，klier的实验小组利用nafion和amberlyst35做催化剂，进行了异丁醇和甲醇之间的同位素标记实验，发现主产物mtbe甲基叔丁基醚中保留了甲醇的O，表明异丁醇通过SN2机理进攻质子化的甲醇得到mtbe，而异丁醇由于空间阻碍，甲醇很难从其背后进攻。酚类和醇类的醚化在nafion树脂催化下，经120-150度，5h反应，可生成芳醚。对苯二酚在75度下，经nafion树脂催化与异丁烯反应2h，其醚化产率为66%。在80度下催化异丁烯与甲醇反应，产物为甲基叔丁基醚，以甲醇计算，产率为81.8%。在nafion树脂的催化作用下，将醇类与过量的二甲氧基甲烷回流加热可制备甲氧基甲醚。